喷雾干燥机技术的广泛应用，其优势明显，但其理论仍然落后于实践。突出表现在干燥理论的实践指导性差。干燥动力学、非球形颗粒的干燥模拟、喷雾干燥机等领域有待进行深入研究。喷雾干燥机热效率低。当进风温度小于1500（；时，其热容量系数较低，为80～400Kj·m-1·h-1·℃-1，因而蒸发强度小；一般的气流干燥、流化床干燥的热容量系数则大于4000Kj·m-1·h-1-℃-1。因此，喷雾干燥机的节能降耗问题就比较突出；亚高温喷雾干燥机（进风温度60～150℃）、常温喷雾干燥机（进风温度60℃以下）、降低能耗与多级干燥都将是今后的研究重点。另外，喷雾干燥机技术与具体的应用领域结合还将用于喷雾冷却造型、喷雾反应、喷雾吸收、喷雾涂层和喷雾造粒等领域。